得意武器について。

例えばファイの時に装備画面で大剣のステを見て下さい。
ルークの時よりも数値が高くなっているはずです。これが得意装備です。

細剣の扱いの悪さ？
どういう事をおっしゃっているのか判りませんが、虎の弱体化はその通りだと思います。
ただ、今でも聖与、転技がありますし、ステは回避と属性が高く、魔弓やハンマーに比べたらずっと良い扱いだと思います。（この二つは今回の限定ガチャで助かりそうですね。）

意外と知らない人が多い様なので補足。
得意装備というのは装備欄に記載のあるアイコンで判別することができますが、これはジョブアビリティーとは別にボーナスがあります。

詳しい計算式はわかりませんがすべての数値におおよそ９％～１０％のボーナスです。
服の上下ついてはボーナスは存在しません。

至高リミブレ（アイコン青）で例を挙げると・・・
ファイターで装備するとＨＰ125（得意装備アイコン赤）
ビショップで装備するとＨＰ125（得意装備アイコン紫）
レンジャーで装備するとＨＰ137（得意装備アイコン青）
となります。

また、このボーナスは装備そのものの数値に影響される為スキル上昇分については反映されません。
例えばスマートファッション腕の回避など。

この事から質問者さんは突剣の不遇について話されてるのかと思います。

アクセサリー枠についてはほぼ誤差の範囲ではありますが、
武器についてはアビリティーにも相まってそれなりに数値が変化してきます。
不遇とまでは思いませんが新ジョブは突剣装備の予感がしますので期待しています。

装備の詳細画面で名前の右横にあるマークでその装備の種類が分かります。ジョブの選択画面の得意装備のところに、付けている装備と同じマークがあればその装備の全てのステータスが10パーセントUPします。(少数点以下切り捨て)
突剣(＝細剣)を得意装備に持っているジョブがないので確かにかわいそうです…(･･;)
ナイトもルークも槍が得意装備になっている(槍だけ2職)ので運営さんが間違えたのかな〜と思っています。

能力ボーナスって、たぶんジョブLvが上がった時に修得するジョブアビリティのことじゃないかなと。

突剣って扱い悪いですか？
・クォーラルの多段でEP溜め
・ミスリルレイピアの全体攻撃で一時的に敵全体のタゲ取り
・転技なら物理主体のボス戦でソロ狩り有効
・癒しの細剣で自己回復(真パピーソロ狩りで使える）
・暗黒の細剣なら自己回避大幅UP
・聖与などの多段必殺は最大50000～60000ダメ
・虎の陣はジェイルバスターの戦いの雄叫びの上位互換
などなど、突剣の中でも武器によって火力にもなるし、盾にもなる。
そのため、武器の組み合わせによって扱いやすさも変わります。

画像は突剣で10000越えダメージ

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細剣は名前だけ。
実際はナイトの得意武器のアレですよー

職毎にジョブアビリティとして
◯◯(武器種) ##(攻撃などのステ) +～％
みたいなのも有りますし、職のところに得意な装備のアイコンが載ってますので、両方ともしっかりと確認すれば得意武器は簡単に分かると思います。