ランキング反映について

だいたい後者で合ってますよー
正確に言えば、
＞｢前日に組んだ全装備パターンのうち、各ステータスごとに最高の値となったものが選出される｣
ではなく、
｢前日に装備した内での最高値となったステータスが反映される｣だと思いますけどね

恐らくですが、
＞また別の日には、3つの装備セットを一度ずつセットした後、適当に装備いじりを行い、変更後のセットは保存せずにおきました。
これですが、セットしただけでメニューを閉じなかった、とかありませんか？
値がランキングに反映されるのは、その日の午前6時までに装備をセットするだけでなく、メニューを閉じる所に判定があるのではないでしょうか。質問者様は恐らくいじった装備のままメニューを閉じて、それ故にABCいずれにも該当しない、いわばD(適当)の値が反映されたのだと考えます

メニューを閉じないと、例えば質問者様がマジシャンだと仮定した場合、装備画面でファイターになろうがナイトになろうが、左上のステータスバー(ジョブ名、レベル、EP等が表示されているバー)には｢マジシャン｣と表示されている筈です
つまり装備画面でいくら装備を弄り回してもそれはステータスに反映されないということで、つまりはランキングの判定材料にもならない、という事じゃないでしょうか？

つまりはランキングに反映させたい値を一日一回装備してメニューを閉じればランキングに反映させることができる、っつー訳ですよ！
因みに自分はこの方法で成功したので正解だと思います…
長文失礼m(_ _)m

200万人のプレイヤーデータから、各種ステータスを大きい順から並び替えて、さらにそのユーザの順位も取ってくるので、結構な時間がかかります。

そのため、AM6時にランキング更新はされますが、それよりももっと前の段階で集計が開始されているハズです。
※Web系プログラムでは、特定の時間になるとプログラムが自動開始されるものが多々あり、主に人のいない（サーバー負荷の軽い）深夜に実行されます。日次バッチっていうやつです。

具体的な集計方法、集計開始時刻は不明ですが、

(「A」の装備セット）
総合の集計開始：Aの総合が適用される
↓
土属性集計開始：Aの土属性が適用される
↓
他属性の集計
↓
（「C」の装備セットに変更）
↓
火属性集計開始：Cの火属性が適用される
↓
集計完了
↓
（「B」の装備セットに変更）

２回目は
（装備いじり中）
↓
総合の集計開始：いじり中の総合が適用
↓
各属性の集計開始：いじり中の属性が適用
↓
集計終了
↓
（「B」セットに変更）

という可能性があるのかなと予想してみた。
※矢印１個がコンマ数秒とかの速さなので、１回目の集計中装備変更が神タイミングですが(笑)