サブウェポン10

他の回答者がルートを書いているので大丈夫かと思いますが補足を…。

■妖精の聖域（夜）ルート
　→夜の聖域の開放クエ終了が条件。
　　終わってないとキノポ王国からワープできない。

　①地下水路マップ左上からエルネの森マップへ。
　②エルネの森マップ左上からキノポ王国へ。
　③キノポ王国をぐるっと回ってマップ中央付近のワープ師に話す。
　④妖精の聖域マップ下から進んでいくとグリーンモコ発見。

■女神像の滝（夜）ルート
　→夜の見張り台開放クエ終了が条件。
　　終わってないと地下水路からワープできない。

　①地下水路入り口のワープ師に話す。
　②夜の見張り台に出たら左下に進んだところでワープ師に話す。
　③ワープ後、上に進み、女神の滝マップへ。
　④女神の滝マップの右上あたりにグリーンモコ発見。

非常に長い道のりにはなりますが、森方向に抜けてもグリーンモコはいます。場所は夜の聖域です。
地下水路→エルネの森→キノポ王国→妖精の聖域、と大移動をすることになりますので時間がかかります。ただ、道なりに進めば行けるので、わかりやすいと言えばわかりやすいかもしれません。夜水路のモンスターが総じて強いので、万一戦闘に入ったらすぐ逃げた方が無難です。
ちなみに私はこのルートで聖域まで移動して狩りました。地味にしんどかったです……

なお、他の回答者さんが示されているルートは確かに近道ですが、夜の見張り台を通る必要があるため、ハンタークエ「夜の見張り台の解放」を済ませていなければ進むことができません。「夜の見張り台の解放」は12章クリアすると出現します。

私もこのクエストにてこずりました(^_^;)

結論から言うと....地下水路やキノポ王国方面にはいません。まずクエストを開始したら、近くにいるワープ師に話しかけて外に出ます。ここでワープ師を使わずに奥に進んでしまうと見つかりません(笑)

外に出てからはそんなに難しくないです。
いなかったらフィールドを変えたり、ワープ師を使ってみて下さい。レアモンではないので見つかると思います。