スキル上げの優先順位

必殺スキレを上げる場合の基準を◎〇△✕で評価してみました（自分基準です）。

闇アサシン
✕ムラサメ：多段化用武器であるムラサメは基本スキレを気にする必要がありません、別にスキレ1で問題ないです。
△羅刹ペルセポネ：羅刹女神はスキレでリミットが上昇しますが、スキレ1毎に25%と高い効果ではないです。それなら火力用羅刹に使った方がいいでしょう。私は羅刹女神＝多段化用武器と考える為上げてません。
〇影獄羅刹：スキレによりリミットが上昇する火力武器の為アサシンなら使い所はここでしょう。ただ、羅刹は多段数でダメを稼ぐ武器なので、もし闇デスペもしていたらスキレソードは其方に振った方がいいかもしれません。
△イザナミ：イザナミはスキレでリミットが上昇しますが、基本一戦に一回しか使えません。また、イザナミは火力武器ではなく多段化用武器なので、ここでスキレソードを使うのは勿体ないです。開幕即必殺で周回を効率良く回したい等でなければ上げる必要はないでしょう。

土デスペ
◎崩獄覇双：メイン火力となる武器です。リミットを上げるためにスキレソードをぶっ込みましょう。とりあえず3は欲しいですが、高ければ高い程良いです。
△ガラディーン：リミットはスキレにて大きく上昇しますが、ガラディーンの本体であるリミプラは変わりません。イザナミと同じく周回効率化以外では上げないでしょう。
✕アイオーン：ムラサメと同理由。
〇覇双タイタン：そのままで考えるなら覇双女神も羅刹女神と同理由で使わないのですが、英雄化した場合リミットとhit数が大きく上昇し、火力武器としての利用も可能となります。その際には必殺スキレも上げて起きたいところです。選択例としては、伝説化ならそのままで英雄化ならスキレ上げ、覇双女神1獄鬼覇双1なら獄鬼に素材突っ込んで覇双女神1または2（獄鬼無し）なら覇双女神に使う、などでしょうか。また、手持ちのスキレソードに余裕があるなら普通に上げてしまっても良いと思います。ちなみに私は崩獄1タイタン1ですがスキレは両方3でどちらも英雄です。

光ヴァル
✕ケリュ：ムラサメと(ry。
✕グラム：スキレでリミットは上がりますが、支援用武器のグラムのリミットを上げて素材分のリターンがあるでしょうか？実装時ならともかく現在他の専用武器がある為これを周回に使う人は少ないのではないかと。簡単に言えば勿体ないです。
✕メサイア：スキレ全く必要ないです、まる
✕クイック：クイックはスキレによってリロ短の効果が変わります。が、わざわざスキレソードを使ってまで上げる必要はないでしょう、スキレ1でも多段して何回か使えば勝手に最大まで短縮します。入手率も昔より高いと思うので上げたければ同武器混ぜて上げましょう。
✕各種蝶：蝶はヴァルガチャを引けば山の様に出てくるハズレ枠です。ガチャを引けば要らなくても手に入るのでスキレソードなんて要りません。と、言うかぶっちゃけスキレ1で充分ですので。

私のスキレソードを使う基準は
①入手率の低い武器
②リミット上昇等明確なメリットがある武器
③使い所を限定されない・されにくい武器
です。光闇のスキレソードは特に入手しにくいので使い所は考えましょう。

スキル上げの優先はフィニッシュ武器です
フィニッシュ武器と言うのは1番火力が出る武器ですね(専用武器は除く)
例を上げると最上位羅刹､覇双､魔剣ですね
他にも英雄女神覇双も上げるべきですかね
スキル上げしてはいけない(してもそんなに意味無い)のは多段系(オシリス､アテナ)､夜叉､紫月､白豪､冥剣､胡蝶と鳳凰以外の天翼ですかね←の名前出したやつは結構スキル上げてしまう人多いので注意
専用武器も周回用でない限り上げなくていいです(ガラ､ベリアルは上げてもいいかな程度でスキル上げてない状態でダメージ振り切れてないなら上げる必要ない)
女神の魔神器に関しては天翼は上げる必要ないと思います他はお好みですが羅刹は上げてもあまり意味なかったな〜って思ってます
質問者さんの武器だと土は崩獄､闇は双連刃ですかね
あとベルは結構出るのでスキルソードで上げる必要はないと思います(どうせスキルソードでは英雄スキル上がらないから)

この質問とは少しズレますがスキレを上げるとどうなるかを把握するのが大事かなと思います。

例えばお持ちのアテナ(ムラサメ・アイオーン・ケリュ)についてスキレソードでは伝説・英雄のスキレが上がりませんからスキレを上げてもアテナの威力が上がるだけです。アテナにダメージを期待する場面はありませんからスキレソードを使うのはもったいないです。伝説スキレを上げるのは有効なので現物同士の合成はもちろんありです。

女神・獄はスキレ上げによるスキル威力・リミット・HP緩和がそのままクエの難易度に直結するため優先度が高くなります。

専用は現在、イザナミ・グラムにダメージを期待する場面がありませんからスキレを上げる必要はありません。
逆にガラディーンは主に周回での必殺ダメージが求められるのでスキレを上げる必要があります。

ヴァルに関してスキレ上げは自分は必要ないかと思います。
蝶はそもそもステが整っていれば回復量が足りないことはありませんし、クイックは書かれているとおり護石に変えて行くことになりますし、護石も比較的手に入りやすいので現物同士の合成がオススメです。

スキレソードは貴重です。基本的には女神・獄などのフィニッシュ武器に使うと良いかと思います。